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| Nombre del proyecto | Identificación del microbioma presente en muestras de pacientes con cuadros clínicos de Tuberculosis pulmonar y extrapulmonar por NGS (Secuenciamiento de Nueva Generación) |
| Resumen ejecutivo | La Tuberculosis es una de las enfermedades más antiguas de la humanidad y continúa siendo un grave problema de salud pública en expansión, reconocida por la OPS como una perpetua amenaza de muerte y sufrimiento además de los altos costos de programas de salud de los países y la baja calidad de vida de los que la padecen. Según la OMS , entre el 2000 y 2020 cerca de un billón de personas se re infectará nuevamente, 200 millones contraerán la enfermedad y 35 millones morirán a causa de la infección, si antes no se promueven medidas de control adecuadas que incluyan aspectos de diagnóstico certeros, tratamientos personalizados, tipos de infección y el estudio de la epidemiología de la enfermedad. Frente a esta problemática se vislumbra la posibilidad de utilizar nuevas técnicas de diagnóstico que permitan establecer quién realmente padece la enfermedad y a qué otras bacterias está asociada. Es por ello que un estudio a nivel molecular y metagenómico ampliaría el conocimiento de bacterias oportunistas en enfermedades bacteriales como la Tuberculosis. Dicho esto, el presente proyecto propone realizar la identificación molecular de bacterias en muestras de pacientes con cuadros clínicos de tuberculosis y evaluar el microbioma asociado, ya que un mal diagnóstico, junto con el desconocimiento de los efectos que pudieran generar la existencia de la microbiota oportunista, que perjudica en muchos casos, el éxito del tratamiento. Para ello se tomarán muestras pulmonares (esputo, lavado bronquioalveolar) y extrapulmonares( liquido pleural, liquido ascitico y orina) de pacientes con cuadros clínicos de Tuberculosis , se realizará la identificacion de Mycobacterium tuberculosis con marcadores moleculares específicos y el secuenciamiento metagenómico por NGS. Los resultados obtenidos nos brindaran la identificación de los géneros bacteriales predominantes en las diferentes muestras, con lo que se espera identificar y analizar el microbioma presente asociado a la tuberculosis y la importancia de este en pacientes con resultados positivos y negativos para M. tuberculosis mediante el análisis molecular y lo que permitirá establecer y comprender las posibles interacciones de la microbiota circundante en esta enfermedad. El estudio se llevará a cabo en el Departamento Académico de Morfología Humana de la Facultad de Medicina, Laboratorio 118, y se realizará en un periodo de 18 meses calendarios. |
| Objetivo del proyecto | Identificar el microbioma presente en muestras de pacientes con cuadros clínicos de Tuberculosis pulmonar y extrapulmonar por NGS (Secuenciamiento de Nueva Generación) |
| Código del proyecto | IBAIB-09-2018 |
| Fecha de inicio | 2019-01-07 |
| Duración | 48 |
| Nombre del esquema financiero | Proyectos de Investigación Básica y Aplicada - UNSA |
| Monitor | Cynthya Ttito Quispe |
| Entidades participantes | Monto (S/) | Total (S/) | Porcentaje | ||
| Monetario | No monetario | Monetario | No monetario | ||
| Universidad Nacional de San Agustin (UNSA) | 250000.00 | 0.00 | 250000.00 | 100.00% | 0.00% |
| ADA OTILIA DEL CARPIO SANZ | 0.00 | 0.00 | 0.00 | 0.00% | 0.00% |
| Palabras clave | Tuberculosis, Secuenciacion deNueva Generación , microbioma, Arequipa, UNSA |
| Justificación del proyecto | En el Perú no se ha realizado investigación dentro del campo de la metagenómica con relación a la tuberculosis, debido al continuo uso de ensayos y métodos estándares sin el desarrollo de nuevas técnicas,provocando desconocimiento de la carga microbiana presente en pacientes con cuadros clínicos de tuberculosis , esto junto con la falta de nuevos métodos y tecnologías complementarias con mayor sensibilidad para el diagnóstico de tuberculosis, está generando que haya un retraso en la comprensión de todas las bacterias asociadas a esta enfermedad, ya que se sabe que la carga microbiana con relación a una enfermedad es de alta importancia, debido que en muchos casos, perjudica el resultado del tratamiento, lo que resulta en un alto porcentaje con posibilidad de muerte del paciente. A si mismo, todo esto conlleva a que se genere resistencia por parte M. tuberculosis y de otros microorganismos patógenos. |
| Hipótesis del proyecto | Existe un microbioma asociado a Mycobacterium tuberculosis en muestras de pacientes con cuadros clínicos que podría estar generando un fenotipo incierto inespecifico y complejo, traducido en un mal pronostico de la enfermedad, convirtiéndola en una enfermedad re-emergente y un problema de salud publica en expasion. |
| Resultados esperados del proyecto | Tres estudiantes con titulo profesional de la UNSA con una publicación (de acuerdo al reglamento). Cinco personas capacitadas en el estudio de microbioma por NGS Dos trabajos aceptados para publicación en WOS o Scopus Una ponencia nacional o internacional Un estudiante de post-grado graduado de doctor. |
| Impactos esperados | La tuberculosis es una de las enfermedades infecciosas más antiguas de la humanidad, sin embargo hasta hoy sigue siendo un problema de salud pública en expansión con alto riesgo sanitario, debido a los diversos factores asociados a Mycbacterium tuberculosis entre ellos la presencia de un microbioma que estaría interactuando con el huésped y generando fenotipos complejos de difícil manejo de diagnóstico y terapéutico. En nuestro estudio esperamos identificar y evaluar las bacterias oportunistas asociadas a la enfermedad, esta identificación servirá de base para en el futuro establecer el manejo óptimo de la enfermedad y contribuir a su erradicación, compromiso adoptado por la OMS y que se debe cumplir hasta el 2030. |
| Equipo técnico | Luis Carlos Lizárraga Vargas; Hugo José Rojas Flores; Rodrigo Alex Caceres Zegarra; Luis Fernando Luna Paredes; Karina Ttito Velasquez; Carmen Rosa Revilla Mogrovejo; Victor German Torres Diaz; Ada Otilia Del Carpio Sanz |